Direction Malte où une église, sous son apparence austère, camoufle de nombreux secrets liés au massacre des Templiers.
Iriya arrivera-t-il à les percer ou sera-t-il contraint de s'en remettre au prétentieux mais au demeurant très doué Professeur Layton ? Seul hic : ce dernier déteste profondément Iriya et travaille dans l'ombre pour le compte d'une autre personne...