Shiina est revenue vivre chez elle, après le retour de son père du camp d'entraînement en Russie.
Mais son quotidien tranquille est perturbé par une série d'incidents, dont l'un semble impliquer un Ryunoko inconnu jusqu'alors. Shiina fait alors la connaissance de Jane, une militaire travaillant pour les services de renseignements américains, qui est à la recherche de son fils Robert. Entre-temps, l'armée américaine a pris le contrôle des opérations, et déploie des moyens considérables pour éliminer le Ryunoko.
Shiina et Jane empêcheront-elles la tragédie de se produire ?