No Oceano Índico, uma embarcação de pesquisa da equipa NUMA está a recolher amostras de água quando um membro da tripulação deteta uma mancha na água. O que a princípio parecia ser uma mancha de óleo rapidamente se transforma numa nuvem de partículas negras que subitamente ataca a embarcação, matando a tripulação e deixando os destroços em chamas.
Algumas horas mais tarde, Kurt Austin e Joe Zavala têm de lidar com as consequências de um acidente que não deixou sobreviventes. Um audacioso plano está em marcha para alterar o clima à escala global através de uma tecnologia concebida para destruir a poluição marítima. Mas a face do inimigo nem sempre é percetível, e sendo esta missão profundamente pessoal para a equipa NUMA, o perigo pode estar muito próximo de casa…