Après un détour par l'année 1967, l'Intégrale X-Men reprend son cours avec la suite et la fin des épisodes publiés en 1987. Tandis que Tornade, privée de ses pouvoirs, est à la recherche de Forge, les X-Men affrontent les Maraudeurs et Mr Sinistre qui cherchent à assassiner Madelyne Prior.
Si le destin des mutants est toujours entre les mains de Chris Claremont, qui assure leur succès depuis 1975, cette année est aussi marquée par l'intervention de Roger Stern qui a enthousiasmé les lecteurs avec la mini-série X-Men Vs Avengers. Les Vengeurs ont décidé que Magnéto devait être arrêté et jugé pour ses crimes passés. Le souci c'est que les X-Men ne partagent pas cette opinion puisque Magnéto s'est rangé de leur côté. La majorité des épisodes sont illustrés par le talentueux Marc Silvestri (Cyberforce).