Recomendaciones para formar una biblioteca (1627) suele ser considerado como el primer manual de biblioteconomía moderno, pero, además, constituye una "biblioteca ideal" de la primera mitad del siglo XVIII. Obra crítica y erudita, representa un lugar de encuentro de los antiguos con los modernos y un eslabón crucial -en general, desapercibido- entre el humanismo y la ilustración. Además de aconsejar sobre cómo adquirir, mantener y ordenar los libros, Naudé se atreve a recomendar y a discutir las obras de más de trescientos autores universales, desde los clásicos hasta sus coetáneos.