« Pitou » raconte l'histoire d'un petit isard avec ses amis Zoé la marmotte, Vinie la perdrix et Jossan le blaireau, qui découvre le monde et qui doit apprendre à survivre dans les hautes montagnes pyrénéennes.
Après avoir subi les assauts de Rana le lynx dans le tome 1, Pitou mesure bien vite que les risques sont nombreux. En effet à l'approche de l'automne vient s'ajouter un danger bien plus grand : le chasseur d'isards. Mais une rencontre et une complicité inattendues entre Pitou et la jolie Sarah, la fille du berger vont-elles remettre en question sa méfiance à l'égard de son pire ennemi, l'homme..?