Norte de Marrocos: Quando a Dra. Kate Warner encontrou a cura para uma pandemia global, achou que também se tinha curado a si própria. Mas estava enganada, ela não tinha ainda percebido o alcance da conspiração. E agora a humanidade enfrenta uma nova ameaça, um inimigo pior do que tudo o que poderíamos imaginar. O colapso da civilização é iminente, o tempo escasseia, mas a esperança renasce por via de uma mensagem codificada, enviada pelo mais improvável de todos aliados.
Observatório de Arecibo, Porto Rico: Mary Caldwell passou grande parte da sua vida pacientemente à espera, a observar as estrelas, à procura de vida inteligente noutras galáxias. Quando finalmente chega uma mensagem, Mary vê-se envolvida numa luta pela sobrevivência, sem saber em quem confiar, sem encontrar um refúgio onde se esconder.
Antártida: Na sequência de A Praga da Atlântida, Dorian Sloane torna se uma presa fácil de uma terrível organização. Com o mundo ameaçado por uma nova catástrofe, Dorian aceita uma última missão: assassinar Kate Warner e David Vale. Se executar com sucesso o objetivo, as respostas às suas perguntas serão reveladas.
Perseguida por Dorian, a equipa de Kate e David refugia-se nas ruínas da nave da Atlântida e a partir dali começa a procurar os segredos de uma antiga cultura que poderá salvar o planeta.