En adoptant Lina, la fille de deux dissidents qu'il vient d'assassiner, le major Anthony imagine régler ses problèmes - sa stérilité, le désir de maternité de sa femme Paloma. Hélas, elle refuse d'élever un enfant qui n'est pas le sien. Et, lorsque le major doit comparaître devant un tribunal pour rendre compte de ses déboires militaires, sa vie devient un cauchemar.
Livrée à elle-même, la jeune Lina décide de partir à la recherche de ses vrais parents, avant de tomber de nouveau dans les mains de mystérieux ravisseurs.
Saga absurde et désespérante, Notre oncle est avant tout une allégorie de la guerre et de la violence, dans un monde où la morale a un prix.
« Je me suis engagé dans l'armée parce que je ne trouvais pas de travail. Je n'avais pas le choix. L'armée, je m'en fichais. J'avais faim, major. Je regardais les gens manger derrière les vitres des cafés et des restaurants. Voilà comment je devais apaiser ma faim : en les regardant. Je me suis engagé dans l'armée parce que j'avais faim.
Maintenant, c'est vous qui avez faim. Ainsi vont les choses. »