Il y a très très longtemps, deux soeurs licornes régnaient ensemble sur le royaume d'Equestria. Mais Célestia a dû envoyer sa petite soeur sur la lune après une dispute. D'après la légende, Luna reviendra pour se venger et plonger le royaume dans la nuit éternelle. Et ce jour est arrivé ! Twilight Sparkle, une jeune licorne, a l'air d'être la seule au courant ! Vite, elle réunit ses cinq nouvelles amies , et ensemble elles partent à la recherche des « éléments de l'harmonie ». Il faut absolument les retrouver pour conjurer le sort !