Medaka Kurokami ha sido elegida presidenta del consejo estudiantil de la Academia Hakoniwa.Emprendedora como pocas, Medaka propone como novedad en el consejo un buzón de peticiones, ya que se ha propuesto resolver cualquier problema quetengan los estudiantes, sin importar lo complejo que sea. Tiene a su equipopara ello, entre los que se encuentra Zenkichi Hitoyoshi (el típico amigo de lainfancia) para llevar adelante su plan. Entre idas de olla, situaciones cómicas y cachondas, Medaka es sin lugar a dudas la más popular del Hakoniwa, y todosse sorprenden por la forma en que consigue sus cometidos. Las cosas toman un tinte más oscuro cuando se descubre la existencia del Flask Plan, unexperimento de la Academia Hakoniwa para producir en masa el efecto"anormal" que otorga habilidades especiales, tales como las descubiertas enalgunos estudiantes que las llevan de nacimiento.