Pendant près d'un demi-siècle, par son action et sa personnalité, le professeur Bernard Hoerni a marqué l'Institut Bergonié, Centre de lutte contre le cancer de Bordeaux et du Sud-Ouest, qu'il a dirigé pendant sept ans.
À l'université Victor-Segalen-Bordeaux 2, des milliers d'étudiants ont suivi son enseignement. L'émergence de la cancérologie en France et en Europe l'a fait assurer diverses responsabilités, comme membre actif de l'Organisation européenne de recherche et de traitement des cancers (OERTC), président de la Société française du cancer ou de l'European association for cancer education (EACE). Son engagement professionnel l'a impliqué au conseil national de l'Ordre des médecins, qu'il a également présidé.