A Vida Misteriosa de René Descartes vai buscar o título aos diversos episódios inexplicáveis e às muitas interrogações que têm preocupado filósofos e não só, desde a sua precoce morte, na Suécia, em 1650. Abordam-se factos como: a importância que sempre deu ao longo de toda a vida aos três sonhos ocorridos de 10 para 11 de Novembro de 1619, que considerou fundamentais para o desenrolar do seu pensamento e obra; a semelhança entre esses sonhos e o sonho e trajecto de Cristão Rosacruz ao ser convidado para as bodas do rei e da rainha nas "Bodas Alquímicas de Cristão Rosacruz"; as constantes viagens entre 1620 e 1622 em que pouco se sabe por onde andou e o que fez; o facto de estar sempre presente nas cidades em que se dizia terem chegado os Rosacruzes; as seis semanas que demorou ainda em Praga depois de o exército que servia ter sido derrotado pelos Habsburgo, durante a Guerra dos Trinta Anos (Batalha da Montanha Branca); as constantes mudanças de residência durante os 19 anos em que viveu na Holanda e que eram apenas conhecidas do amigo, Padre Mersenne; o facto de só receber correspondência em locais que não denunciassem essas moradas; a razão por que afirmou que andava pela vida "mascarado"; as razões que o levaram a deixar a Holanda e viajar para a Suécia; a semelhança de inúmeras frases e ideias suas com as consignadas na literatura rosacruz do século XVII, entr muitos outros.
Todos estes "mistérios" são contextualizados na época em que viveu, no círculo de amigos filósofos e cientistas do seu tempo, como Galileu, Faulhaber, Roberval, Balzac, Mersenne, Gassendi, Montaigne, Comenius, Huygens, Pascal, Fermat, muitos dos quais eram, declaradamente, Rosacruz.