Ao longo dos séculos, a história da Igreja tem sido marcada por episódios polémicos, situações enigmáticas, experiências estranhas e personagens controversas. Há ainda muitos mistérios por esclarecer, mas o Antigo e o Novo Testamento contêm algumas respostas às principais inquietações dos crentes e não crentes. De facto, é precisamente nas Escrituras que se encontram respostas a dúvidas fundamentais: Quem é Deus? E o diabo, existe? Existem outras formas de vida além das que se encontram na Terra? Que segredo esconde Fátima? Os grandes mistérios da Igreja parte da análise dos principais textos sagrados e de uma profunda pesquisa da história da Igreja para dar resposta a estes e outros mistérios que têm perdurado ao longo do tempo.