Numa rua pouco movimentada de Tóquio existe uma loja secreta, invisível para muitas pessoas. A maioria vê um acolhedor restaurante de ramen. Apenas os escolhidos - aqueles que estão perdidos - conseguem encontrá-la e lá depositar os seus mais profundos arrependimentos.
O proprietário reformou-se e a sua filha, Hana Ishikawa, é a herdeira. Mas a primeira manhã de trabalho dela não podia começar pior: Hana encontra a loja assaltada e o pai está desaparecido. É então que entra em cena um encantador desconhecido. Keishin, um jovem físico, é muito diferente dos outros clientes - ele oferece ajuda, em vez de a procurar.
Hana e Keishin vão atravessar poças de chuva e percorrer a ponte que cruza a madrugada, entre origamis e um mercado noturno nas nuvens, numa viagem por um mundo místico em busca do pai de Hana e das escolhas roubadas.
Mas à medida que se aproximam da verdade, Hana sabe que tem de revelar um segredo e fazer uma escolha a que nunca poderá renunciar.
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