Jean Second n'est l'auteur que de deux des trois Itineraria qui constituent le tome V de ses oeuvres complètes : le premier qui narre le voyage de Malines à Bourges, du 4 au 19 mars 1532, pour aller suivre l'enseignement du grand juriste italien André Alciat, et le troisième qui retrace le périple, long et difficile, de Bruxelles en Aragon, à travers les Flandres, la France et l'Espagne, durant près d'un mois et demi (du 28 mai au 12 juillet 1533) et permettra au poète de devenir secrétaire de l'archevêque de Tolède, puis de Charles Quint en personne. Quant au deuxième de ces Itineraria, relatant le retour de Bourges à Malines du 4 au 16 mars 1533, il est ici prouvé qu'il est l'oeuvre de son frère aîné qui l'accompagnait. Ces Carnets de voyage constituent un précieux témoignage sur les conditions matérielles du voyage en ce début de XVIe siècle (itinéraires, état des routes, allure, hébergement, dangers, etc.) et sur l'existence d'une res publica litterarum, véritable réseau d'humanistes itinérants, qui sillonnent l'Europe d'une université à l'autre pour parfaire leur formation.