Michel, um jovem engenheiro e importante alquimista, que levava uma vida pacata trabalhando no interior da França, recebe um convite para trabalhar na reforma da catedral de Notre-Dame de Paris e fazer um ritual místico para tornar invencível Napoleão III, o poderoso imperador que traiu seu pai e a França.
Napoleão III, conhecedor do ritual e dos elementos fundamentais da alquimia, sabia que a Notre-Dame, construída em cima de um antigo local sagrado celta, era o local perfeito, só precisava de um mestre em sabedorias herméticas para realizar o seu plano.
Com a ajuda do famoso escritor Victor Hugo e de uma sociedade secreta, o jovem alquimista tentará descobrir a fórmula do elixir de Nicolas Flamel e se vingar do imperador e do perigoso grupo clandestino que dominava Paris com violência.