Depois de deixarem para trás os problemas com a Madame Kurenai, a tripulação da Edens Zero vê-se perante um novo inimigo: o temido Drakken Joe.
Fascinado pela lendária nave, ele prepara-se para a reclamar como sua — juntamente com todos os tesouros que possa esconder. E, à semelhança de Shiki, também conta com uma tripulação poderosa.
Será que Shilki e os amigos vão conseguir vencer mais uma vez?