Rarement un aussi petit cours d'eau n'aura suscité dans l'histoire autant de disputes et d'accrochages entre ses riverains français et espagnols. Si les accords de 1685 sur l'utilisation de la Bidassoa ont pu garantir une certaine stabilité durant deux siècles, l'ère moderne devra imposer une réglementation plus structurée pour faire face à des conflits qui redoublent d'intensité. L'intervention de canonnières pour faire respecter la loi va démontrer les avantages de cette diplomatie armée, au point que l'on confie cette mission aux officiers de marine des deux pays.
Ainsi, depuis plus d'un siècle, ces derniers agissent en parfaite symbiose avec la société civile et les traditions d'Euskal Herria, dans une région fortement ancrée dans la tradition maritime.