Aqueduto conta a história de um professor universitário de desenho e da sua relação com o seu espaço próximo e a sua cidade de Lisboa durante a pandemia de COVID-19, durante o ano de 2020. E um documentário gráfico assombrado por acontecimentos sobrenaturais, justificáveis pela situação de exceção que se viveu. Com o decorrer do ano pontuado por eventos da eleição presidencial americana, vai-se afirmando uma ópera com duas personagens principais: a Basílica da Estrela e o Aqueduto das Águas Livres.
Outras personagens menores, como o apartamento do autor e o complexo das Amoreiras, também participam no drama. Pelo meio, há uma promessa de felicidade intemporal no cenário arcadiano do Algarve que logo é negada pelo agravamento da situação sanitária. Do outro lado do Atlântico, apesar de um esplendoroso novembro, a tensão vira a tornar-se insuportável e acontecimentos impensáveis virão a desenrolar-se.
No fim, tudo se resume a uma luta entre Loucura e Razão, entre Fortuna e Virtude.