Sejam bem-vindos de volta à Ilha dos Pássaros, uma comunidade feliz e pacífica de aves — graças ao Red, ao Bomb e ao Chuck, que salvaram todos os seus amigos com penas de uma guerra feroz contra o Rei Leonard e os porcos! Bom, esse conflito acabou — mais ou menos. Agora pássaros e porcos enfrentam-se numa guerra de partidas — com travessuras feitas nos dois lados do mar. Mas quando uma nova vilã, uma águia chamada Zeta, ameaça destruir as Ilhas dos Pássaros e dos Porcos, os dois grupos têm de pôr de parte os desentendimentos e unir as suas forças para combater o inimigo emplumado.
Agora o Red, o Chuck, o Bomb e o Super Águia, juntamente com a irmã do Chuck, Silver, têm de trabalhar juntos com os porcos, entre eles o Leonard e a Leonor, a sua nova assistente, para travar a Zeta e a sua superarma vulcânica de destruição! Já mencionámos que também há passarinhos nesta história?