A variedade dos fatores que envolvem a transmissão e permanência da esquistossomose em uma determinada área dificulta as ações preconizadas pelo Programa de Controle da Esquistossomose (PCE), em que há o intuito de associar ações de erradicação, controle e prevenção em regiões endêmicas. O presente trabalho teve como objetivo analisar o desempenho do Sistema de Vigilância Epidemiológica da Esquistossomose no Estado de Sergipe, tomando como base os conceitos atuais de vigilância em saúde e o papel conferido aos estados e municípios, por meio da Portaria do Ministério da Saúde nº 1.399, de 15 de dezembro de 1999.