Après la mort suspecte de son ami, le père Andréi, dans le train qui le ramenait du Vatican, le père Nil, un bénédictin qui enseigne l'Evangile de Jean aux novices de l'abbaye Saint-Martin près d'Orléans, décide de reprendre l'enquête. Andréi détenait les preuves de l'existence d'un treizième apôtre et d'une épître dangereuse pour l'Eglise qui affirme que Jésus n'était qu'un prophète inspiré -et non le fils de Dieu. Le père Nil découvre alors une version inédite des débuts du christianisme : la communauté des Nazoréens, écartée par Pierre et Paul de l'église officielle, qui aurait perduré jusqu'au VIIe siècle et serait à l'origine de l'Islam. Tandis qu'il poursuit ses recherches, les proches du Pape, factions rivales, sociétés secrètes (dont la Congrégation de la foi et la société Saint Pie V), s'activent à récupérer par tous les moyens la conclusion de l'enquête. Du Mossad au Fatah, tous ont leurs raisons pour que ce 13e apôtre reste un secret bien gardé...
Un roman passionnant, érudit, documenté autour de l'histoire véridique d'une secte dont le prophète fut crucifié. Transmise depuis deux mille ans par la voie d'un papyrus, caché dans la grotte de Qumran, elle a échappé à l'incendie d'Alexandrie et aux archéologues de la mer Morte, mais était bien connue des Templiers.