À St Kleio, la vie reprend son cours après les événements tragiques du gala. Alors que de nombreux élèves pleurent la mort ou la disparition de leurs camarades, Rockswell n'a qu'une idée en tête : former au plus vite une nouvelle génération de clones.
Sigmund, Élisabeth et les autres, eux, cherchent des réponses. Et Khi, qui a accepté de se livrer aux autorités de l'école, pourrait bien leur en apporter ! Le mystérieux sosie de Shiro décide en effet de leur raconter ce qui s'est passé plusieurs années auparavant, quand il vivait encore à l'académie.