Arsénio M. Fialho
Biografia
Professor Associado - Departamento de Engenharia Química e Biológica do Instituto Superior Técnico; Investigador do Instituto de Biotecnologia e Bioengenharia - Centro de Engenharia Biológica e Química.
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O Mundo do RNA
Este livro, de fácil leitura, proporciona todos os elementos básicos da Biologia do RNA. Expõe de forma sucinta e actualizada as interacções entre os princípios fundamentais e as suas aplicações, utilizando exemplos e incluindo uma representação gráfica de qualidade. Dividido em três partes, o livro cobre os princípios do processo de transcrição, controlo pós-transcricional e a descrição de novas tecnologias e instrumentação baseadas no RNA.
Esta obra resulta de um acordo entre a Sociedade Portuguesa de Genética e a Editora Lidel. Foi idealizada para um público-alvo universitário pertencente a um alargado leque de licenciaturas no domínio das Ciências Biológicas. Os assuntos tratados, bem como a sua actualidade, irão ainda certamente ao encontro de conteúdos programáticos ministrados em diferentes cursos de pós-graduação, programas de actualização para Professores do ensino secundário, bem como a público geral que se interesse pela importância deste tema. Esta obra constitui uma introdução essencial ao estudo do RNA, uma disciplina em rápido crescimento, cada vez mais reconhecida como crucial no controlo da expressão génica como o demonstra a recente atribuição de dois prémios Nobel no domínio do RNA.
Fundamentos da transcrição em procariontes e eucariontes
Regulação da transcrição em procariontes
Transcrição em eucariontes e sua regulação
Mecanismos associados à terminação e formação do terminal 3' do RNA
Transcrição alternativa e editação de RNA
Vírus RNA
Ribonucleases e controlo pós-transcricional da expressão génica
Desenvolvimento embrionário: uma questão de RNA
Tráfego de RNA e patogénese
Controlo de qualidade do RNA mensageiro em mamíferos - mecanismos de degradação
Análise do transcritoma através da tecnologia de microarrays
As complexas redes de regulação de expressão genética da levedura
RNA de interferência e RNomics
Parte I
TRANSCRIÇÃO
1 Fundamentos da Transcrição em Procariontes e Eucarionte
Graça Vieira / Helena Paveia
Introdução
Transcrição em Bacteria
Transcrição em Eucariontes
Transcrição em Archae
Bibliografia
2 Regulação da Transcrição em Procarionte
Isabel M. G. de Sá-Nogueira
Introdução
Factores de Transcrição
Regulação Negativa e Positiva
Regulação por Atenuação
Bibliografia
3 Transcrição em Eucariontes e sua Regulação
Regina Menezes / Tracy Nevitt / Claudina Rodrigues-Pousada
Introdução
Multiplicidade das Polimerases
A Estrutura dos Factores de Transcrição
Transcrição
Bibliografia
4 Mecanismos Associados à Terminação da Transcrição e Formação do Terminal 3’ do RNA
Alexandra Moreira / Pedro Pinto
Introdução
Terminação da Transcrição
Processamento do Terminal 3' de RNAs
Bibliografia
5 Transcrição Alternativa e Editação do RNA: uma Contribuição Essencial na Evolução do Genoma
Maria Leonor Cancela / Vincent Laizé
Introdução
Splicing Alternativo
Uso Alternativo de Promotores
Poliadenilação Alternativa
Editação do RNA
A Evolução do Genoma Contribuiu para Aumentar a Diversidade de Transcritos
O Mundo do RNA: novos desafios e perspectivas futura
Bibliografia
6 Vírus RNA
José Azevedo-Pereira / João Gonçalves / José Moniz Pereira
Introdução
Vírus RNA - Modelos de Replicação
Mecanismos de Variabilidade
Mecanismos de Recombinação
Troca Genética
Replicase Viral
Hipermutagénese e Deaminação: um Sistema Celular de Protecção Antiviral Implicações da Diversidade dos Vírus de RNA
Bibliografia
Parte II
FACTORES PÓS-TRANSCRICIONAIS
7 Ribonucleases e Controlo Pós-transcricional da Expressão Génica
Ana Barbas / José M. Andrade / Arsénio M. Fialho / Cecília M. Arraiano
Introdução
O Mundo do RNA/RNA World
O Admirável Novo Mundo do RNA
Bibliografia
8 Desenvolvimento Embrionário: uma Questão de RNA
Raquel P. Andrade / Isabel Palmeirim
Introdução
Localização de mRNA e sua Função no Desenvolvimento
Um Relógio de mRNA no Controlo Temporal do Desenvolvimento Gradientes de mRNA num Contexto Multicelular
MicroRNAs no Desenvolvimento
Bibliografia
9 Tráfego de RNA e Patogénese
Margarida Gama-Carvalho / Maria Carmo-Fonseca
Introdução
Regras Básicas do Transporte Núcleo-citoplasmático
Tráfego Núcleo-citoplasmático de RNA: Vias de Exportação de RNAs Não Codificantes
Tráfego Núcleo-citoplasmático de RNA: Vias de Exportação do mRNA
Movimento Intranuclear de RNAs e Interacção com o Poro
Tráfego de mRNA no Citoplasma
Perspectivas Futuras
Bibliografia
10 Controlo de Qualidade do RNA Mensageiro em Mamíferos
mecanismos de Degradação
Ana Luísa Silva / Luísa Romão
Introdução
Mecanismo de Decaimento do mRNA Mediado por Mutações Nonsense
Outros Mecanismos de Controlo de Qualidade do mRNA
Bibliografia
11 Análise do Transcritoma através da Tecnologia de Microarrays
Jörg D. Becker / Leonilde M. Moreira
Introdução
Tecnologias de Microarrays de DNA
Planeamento Experimental e Controlos a Introduzir
Normalização e Computação dos Valores de Expressão Génica
Detecção de Diferenças na Expressão Génica - Análise Supervisionada
Análise Exploratória - Não Supervisionada
Análise Funcional
Aplicações do Estudo dos Perfis de Expressão Génica
Tendências Emergentes e Perspectivas Futuras
Bibliografia
12 As Complexas Redes de Regulação de Expressão Génica na Levedura abordagens à Escala do Genom
Isabel Sá-Correia / Miguel Cacho Teixeira
Introdução
As Complexas Redes de Regulação da Expressão Génica: Saccharomyces cerevisiae com modelo experimental
As Redes de Regulação Transcricional Subjacentes à Resposta Global da Levedura a Stress
Abordagens de Análise da Expressão Génica Global que permitem Delinear as Complexa
Redes de Regulação
A Bioinformática e as Bases de Dados para a Exploração da Informação Resultante d
Aplicação de Abordagens Globais
Bibliografia
13 RNA de Interferência e RNomic
Sandra C. Viegas / Patrick Freire / Cecília M. Arraiano
Introdução
RNómica
Processos de Silenciamento de RNA
Tipos de Pequenos RNAs
Processamentos dos dsRNAs Precursores
Formação dos Complexos de Silenciamento Génico
Mecanismos de Clivagem e Repressão Traducional
A Caminho dos P-bodies: degradação ou armazenamento?
Modificações do DNA Celular: formação da hetrocromatina e silenciamento génico
Mecanismos de Amplificação da Resposta de Silenciamento
Funções dos microRNAs de Animais
Silenciamento de RNA nas Plantas
Terapêutica
Bibliografia
Esta obra resulta de um acordo entre a Sociedade Portuguesa de Genética e a Editora Lidel. Foi idealizada para um público-alvo universitário pertencente a um alargado leque de licenciaturas no domínio das Ciências Biológicas. Os assuntos tratados, bem como a sua actualidade, irão ainda certamente ao encontro de conteúdos programáticos ministrados em diferentes cursos de pós-graduação, programas de actualização para Professores do ensino secundário, bem como a público geral que se interesse pela importância deste tema. Esta obra constitui uma introdução essencial ao estudo do RNA, uma disciplina em rápido crescimento, cada vez mais reconhecida como crucial no controlo da expressão génica como o demonstra a recente atribuição de dois prémios Nobel no domínio do RNA.
Fundamentos da transcrição em procariontes e eucariontes
Regulação da transcrição em procariontes
Transcrição em eucariontes e sua regulação
Mecanismos associados à terminação e formação do terminal 3' do RNA
Transcrição alternativa e editação de RNA
Vírus RNA
Ribonucleases e controlo pós-transcricional da expressão génica
Desenvolvimento embrionário: uma questão de RNA
Tráfego de RNA e patogénese
Controlo de qualidade do RNA mensageiro em mamíferos - mecanismos de degradação
Análise do transcritoma através da tecnologia de microarrays
As complexas redes de regulação de expressão genética da levedura
RNA de interferência e RNomics
Parte I
TRANSCRIÇÃO
1 Fundamentos da Transcrição em Procariontes e Eucarionte
Graça Vieira / Helena Paveia
Introdução
Transcrição em Bacteria
Transcrição em Eucariontes
Transcrição em Archae
Bibliografia
2 Regulação da Transcrição em Procarionte
Isabel M. G. de Sá-Nogueira
Introdução
Factores de Transcrição
Regulação Negativa e Positiva
Regulação por Atenuação
Bibliografia
3 Transcrição em Eucariontes e sua Regulação
Regina Menezes / Tracy Nevitt / Claudina Rodrigues-Pousada
Introdução
Multiplicidade das Polimerases
A Estrutura dos Factores de Transcrição
Transcrição
Bibliografia
4 Mecanismos Associados à Terminação da Transcrição e Formação do Terminal 3’ do RNA
Alexandra Moreira / Pedro Pinto
Introdução
Terminação da Transcrição
Processamento do Terminal 3' de RNAs
Bibliografia
5 Transcrição Alternativa e Editação do RNA: uma Contribuição Essencial na Evolução do Genoma
Maria Leonor Cancela / Vincent Laizé
Introdução
Splicing Alternativo
Uso Alternativo de Promotores
Poliadenilação Alternativa
Editação do RNA
A Evolução do Genoma Contribuiu para Aumentar a Diversidade de Transcritos
O Mundo do RNA: novos desafios e perspectivas futura
Bibliografia
6 Vírus RNA
José Azevedo-Pereira / João Gonçalves / José Moniz Pereira
Introdução
Vírus RNA - Modelos de Replicação
Mecanismos de Variabilidade
Mecanismos de Recombinação
Troca Genética
Replicase Viral
Hipermutagénese e Deaminação: um Sistema Celular de Protecção Antiviral Implicações da Diversidade dos Vírus de RNA
Bibliografia
Parte II
FACTORES PÓS-TRANSCRICIONAIS
7 Ribonucleases e Controlo Pós-transcricional da Expressão Génica
Ana Barbas / José M. Andrade / Arsénio M. Fialho / Cecília M. Arraiano
Introdução
O Mundo do RNA/RNA World
O Admirável Novo Mundo do RNA
Bibliografia
8 Desenvolvimento Embrionário: uma Questão de RNA
Raquel P. Andrade / Isabel Palmeirim
Introdução
Localização de mRNA e sua Função no Desenvolvimento
Um Relógio de mRNA no Controlo Temporal do Desenvolvimento Gradientes de mRNA num Contexto Multicelular
MicroRNAs no Desenvolvimento
Bibliografia
9 Tráfego de RNA e Patogénese
Margarida Gama-Carvalho / Maria Carmo-Fonseca
Introdução
Regras Básicas do Transporte Núcleo-citoplasmático
Tráfego Núcleo-citoplasmático de RNA: Vias de Exportação de RNAs Não Codificantes
Tráfego Núcleo-citoplasmático de RNA: Vias de Exportação do mRNA
Movimento Intranuclear de RNAs e Interacção com o Poro
Tráfego de mRNA no Citoplasma
Perspectivas Futuras
Bibliografia
10 Controlo de Qualidade do RNA Mensageiro em Mamíferos
mecanismos de Degradação
Ana Luísa Silva / Luísa Romão
Introdução
Mecanismo de Decaimento do mRNA Mediado por Mutações Nonsense
Outros Mecanismos de Controlo de Qualidade do mRNA
Bibliografia
Parte II
NOVAS TECNOLOGIAS NA ÁREA DO RNA11 Análise do Transcritoma através da Tecnologia de Microarrays
Jörg D. Becker / Leonilde M. Moreira
Introdução
Tecnologias de Microarrays de DNA
Planeamento Experimental e Controlos a Introduzir
Normalização e Computação dos Valores de Expressão Génica
Detecção de Diferenças na Expressão Génica - Análise Supervisionada
Análise Exploratória - Não Supervisionada
Análise Funcional
Aplicações do Estudo dos Perfis de Expressão Génica
Tendências Emergentes e Perspectivas Futuras
Bibliografia
12 As Complexas Redes de Regulação de Expressão Génica na Levedura abordagens à Escala do Genom
Isabel Sá-Correia / Miguel Cacho Teixeira
Introdução
As Complexas Redes de Regulação da Expressão Génica: Saccharomyces cerevisiae com modelo experimental
As Redes de Regulação Transcricional Subjacentes à Resposta Global da Levedura a Stress
Abordagens de Análise da Expressão Génica Global que permitem Delinear as Complexa
Redes de Regulação
A Bioinformática e as Bases de Dados para a Exploração da Informação Resultante d
Aplicação de Abordagens Globais
Bibliografia
13 RNA de Interferência e RNomic
Sandra C. Viegas / Patrick Freire / Cecília M. Arraiano
Introdução
RNómica
Processos de Silenciamento de RNA
Tipos de Pequenos RNAs
Processamentos dos dsRNAs Precursores
Formação dos Complexos de Silenciamento Génico
Mecanismos de Clivagem e Repressão Traducional
A Caminho dos P-bodies: degradação ou armazenamento?
Modificações do DNA Celular: formação da hetrocromatina e silenciamento génico
Mecanismos de Amplificação da Resposta de Silenciamento
Funções dos microRNAs de Animais
Silenciamento de RNA nas Plantas
Terapêutica
Bibliografia
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